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Accueil > Formation > L'offre de formation > Master mention Sciences du Génome et des Organismes (M1 Tronc commun) > Master mention Sciences du Génome et des Organismes M2 spécialité Génomique et Post-Génomique

Master mention Sciences du Génome et des Organismes (M1 Tronc commun)

Master mention Sciences du Génome et des Organismes M2 spécialité Génomique et Post-Génomique
Sciences, Technologies, Santé

Année : 2012 / 2013

dernière mise à jour : 11/04/2012

    Objectifs et particularités de la formation

    La spécialité Génomique et Post-Génomique (GPG) se distingue par 3 parcours distincts (Génomique Microbienne (GM), Génomique Végétale (GV) et Génie Biologique et Informatique (GBI)) mais chevauchants. Elle est appuyée par de nombreux laboratoires équipés de plateformes technologiques très modernes de Genopole® et qui produisent une recherche de qualité, compétitive et internationalement reconnue, ainsi qu’un réseau de laboratoires nationaux et internationaux permettant la mobilité des étudiants. La composition de l’équipe pédagogique, dont l’objectif est axé sur une réelle intégration des étudiants dans le monde de la recherche et de l’entreprise, en fait une spécialité de référence permettant un rayonnement international de l’Université d’Evry-Val-d’Essonne.

    Francisco J. PEREA  - Genethon Evry, Le responsable de la Mention SGO.

    Type de master

    Recherche et professionnel

    Stage

    Le second semestre des différents parcours de la spécialité GPG est constitué d’un stage d’une durée de 22 semaines qui s’effectue en laboratoire ou en entreprise.
    Les étudiants devront rechercher, lors du 1er semestre, le lieu de leur stage et pourront être aidés par l’équipe pédagogique de la spécialité GPG.  Le sujet du stage proposé par les laboratoires ou les entreprises devra être validé par l’équipe pédagogique afin de s’assurer de sa cohérence avec les enseignements proposés dans la formation.
    Les différents laboratoires, en particulier les UMR CEA, CNRS, INSERM, INRA, sont des laboratoires naturels d’accueil pour le stage des étudiants ainsi que pour la poursuite en Doctorat. Un partenariat étroit a été mis en place depuis de nombreuses années avec les entreprises de Genopole®, pour l’accueil d’étudiants (notamment GBI) en stage et pour la participation de professionnels dans le cadre d’enseignements spécifiques (création d’entreprise, propriété intellectuelle, connaissance du monde professionnel).

    Les étudiants seront encouragés à faire leur stage à l’étranger dans la mesure du possible, dans des équipes avec lesquelles collaborent les enseignants afin d’assurer un meilleur suivi de l’étudiant. Le suivi des stagiaires à l’étranger sera effectué par le tuteur universitaire et (pour le parcours GBI) le Directeur d’Etudes.

    Pour tous les stages, un tuteur universitaire sera chargé de suivre l’étudiant lors du second semestre afin de s’assurer que le stage se passe dans de bonnes conditions aussi bien côté entreprise ou laboratoire que côté étudiant.

    Laboratoires de rattachement

    Les Institutions de recherches citées dans le tableau suivant se sont engagées, dans le cadre de cette spécialité, à participer activement à l’accueil des stagiaires, en plus de leur participation à l’enseignement par des séminaires et cycles de conférences.
    De même les modules du parcours Génomique Microbien (GM) sont mutualisés avec le Master : Biologie des microorganismes : Approches Génomiques et Bioinformatiques proposé par l’Université de Versailles Saint Quentin en Yvelines.

    Equipes de recherche labellisées à l’appui de la spécialité :

    Equipe

    Label

    Etablissement

    Responsable

    Qualité / HDR

    Laboratoire Statistique et Génome

    CNRS UMR 8071-INRA UMR1152-Université d’Evry

    Tour Evry 2

    B. Prum

    PR, HDR

    Unité de Recherche en Génomique Végétale

    UMR 1165 INRA / CNRS / UEVE

    Génopole

    H. Hirt

    DR

    CEA-Institut de Génomique

    -Centre National de Génotypage

    Développement Technologique

    Génopole

    I. Gut

     

    Centre National de Génotypage

    INRA

    Génopole

    D. Brunel

    DR

    CEA-Institut de Génomique

    Genoscope

     

    UMR8030 CNRS / CEA / UEVE

    Génopole

    J. Weissenbach

    DR

    Nutrition azotée des Plantes

    INRA

    Versailles

    F. Vedèle

    DR

    Génétique et Amélioration des plantes

    INRA

    Versailles

    C. Rameau

    DR

    Laboratoire de Biologie Cellulaire

    INRA

    Versailles

    H. Höfte

    DR

    Méthodologie Statistique et Epidémiologie Génétique des Maladies Multifactorielles

    Inserm U794

    Paris

    F. Demenais

     

    CEA-service de génomique fonctionnelle

    CEA

    Genopole

    X. Gidrol

    DR

    Unité Structure et Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques, Evry

    UEVE-INSERM U829

    Université d’Evry-Val-d’Essonne (UEVE)

    P. Curmi

    DR

    Laboratoire Informatique, Biologie Intégrative et Systèmes Complexes (IBISC),

    FRE 3190 CNRS – UEVE Genopole, Evry

    UEVE

    Jean-Louis Giavitto

    DR

    UCBL, Ecologie Microbienne du Sol

    UMR CNRS 5557

    Université Claude Bernard, Lyon 1

    R. Bally

    DR

    Biologie moléculaire du gène chez les extrêmophiles

     

     

    IGM

    UPS

     

    Université Paris XI

    Patrick Forterre

    PR

    Unité Biochimie Bactérienne

    INRA

    INRA CR Jouy en Josas

    Véronique Monnet

    Dr

    UMR Microbiologie du Sol et de l'Environnement,

    UMR CNRS-INRA Dijon

    INRA/Université de Bourgogne

    P. Lemanceau

    DR

    Ecophysiologie Moléculaire des Microorganismes,

    UMR7156

    Université Louis Pasteur, Strasbourg

    P. Bertin

    PR, HDR

    IFP- Département Biotechnologie

    IFP

    IFP- Rueil Malmaison

    F. Monot

    DR

    Unité d’Ecologie et Physiologie du système digestif 

    INRA

    INRA Jouy En Josas  

    G. Corthier

    J. Doré

    DR, HDR

    Equipe Ecogénomique des interactions biotiques

    UMR1136 : Interactions Arbres-Microorganismes 

    Centre INRA de Nancy

    F. Martin

    DR

    Unité Intégration et Analyse Génomiques

    Plateforme 4

    Génopole

    Institut Pasteur

    Institut Pasteur, Paris

     

    I. Moszer

    C. Dauga

    P. Dehoux

    DR

    DR, HDR

    DR

    Unité de Recherche Hydosystèmes et Bioprocédés

    UR HBAN

    Cemagref, Antony

    C. Loumagne

    DR, HDR

    Partenariats

     

    • Industriels : 

    - BIOSOLUTION

    - SERVIER

    - ARCOPHARM

    - ATRAGEN

    - LIBRAGEN

    - BIOQUANTA.  

    •  Institutionnels :

    - INRA

    - CEMAGREF

    - IFP

    En savoir plus

    Pour continuer à vous informer, conforter votre orientation, valider vos choix, venez nous rencontrer :

    • Au Pôle d’Information et d’Orientation des Lycéens et des Etudiants (Bâtiment Maupertuis) pour toutes informations sur l’orientation, les métiers, les parcours, etc.,
    • Lors de la Soirée Portes Ouvertes Master le mardi 6 décembre, de 17h30 à 20h30,
    • Lors de la Journée Portes Ouvertes, le samedi 11 février 2012 de 10h à 17h,
    • Sur les salons (Salon de l’étudiant, de l’éducation, des Masters...)

    L’Université d’Evry-Val-d’Essonne est une université à taille humaine de 10 000 étudiants et accessible par un grand nombre de moyens de transport.

    Pour s'y rendre, cliquez sur le lien suivant:

    http://www.univ-evry.fr/fr/nous_contacter/plan_d_acces.html

    Débouchés Professionnels

    Métiers possibles à l’issue du Master
    • Parcours GM et GV :

    Chef de projet dans le secteur de recherche et développement ; ingénieur d’études, recherche et développement en biologie ou domaine de la santé ou de l’agronomie,  cadre technique de contrôle qualité en biologie ou domaine de la santé,…

    • Parcours GBI :

    Cadre technique en data-management dans l’industrie pharmaceutique, chef de projet bioinformatique, développeur informatique, ingénieur logiciel en bioinformatique, développeur de Bases de Données en biologie ou domaine de la santé, …

    La PAE (La Plate-forme d'Accès à l'Emploi)

    L’Université d’Evry-Val-d’Essonne a été parmi les premières universités à mettre en place une interface avec le monde socio-économique, la Plateforme d’Accès à l’Emploi (PAE),  dont les missions :

    • suivre  l’insertion professionnelle des diplômés via des analyses qualitatives et quantitatives d’enquêtes réalisées auprès d’anciens étudiants,
    • assurer les relations avec les entreprises -structures publiques et privées- pour relier formations, métiers et compétences  mais aussi  réfléchir sur les emplois de demain
    • développer les actions de préparation des étudiants à l’insertion professionnelle,
      concourrent à une meilleure employabilité de ses diplômés.

    En tant qu’étudiant de l’université, vous pouvez bénéficier dans votre cursus d’un accompagnement personnalisé de la PAE pour la structuration de votre projet professionnel et pour la recherche de stages qui font partie intégrante de votre formation.
    La PAE assure également l’organisation :

    • de conférences pour vous faire découvrir le monde économique et l’entreprenariat,
    • de forums où des représentants d’entreprises vous reçoivent individuellement afin vous faire connaître les  attentes et besoins en compétences des entreprises.

    Poursuite des études

    Les différents laboratoires, en particulier les UMR CEA, CNRS, INSERM, INRA sont des laboratoires d’accueil et sont très logiquement indiqués pour la poursuite en Doctorat. La majorité des enseignants impliqués dans le domaine « Sciences du Génome et des Organismes» font partie d’unités mixtes présentes sur le site de Genopole®.

    Des possibilités sont ouvertes pour les étudiants souhaitant préparer leur Ph. D à l’étranger dans le cadre des collaborations déjà mises en places par les différents laboratoires partenaires.

    Conditions d'admission

    L’admission dans un parcours débouchant sur le Master est subordonnée à la détention d’un M1, d’une maîtrise ou d’un niveau reconnu équivalent.

    Dans le cas d’une réorientation à l’intérieur de la spécialité GPG, des passerelles ne pourront être envisagées qu’entre les parcours Génomique Microbienne (GM) et Génomique Végétale (GV) et s’effectuent en accord avec les responsables du parcours.

    Les études, les expériences professionnelles, les acquis personnels peuvent être validés en suivant la procédure du service VAE de l’Université d’Evry-Val-d’Essonne.

    Informations Pratiques

    • Responsable : Francesco Javier PEREA
    • Courriel : respmasterbio@univ-evry.fr
    • Equipe :

      Responsable M2 :

      Abdelghani SGHIR, Institut de Génomique, CEA-Genoscope, Laboratoire de Métagénomique des Procaryotes: Responsable de la spécialité et du parcours Génomique microbienne

      Carène RIZZON: parcours Génie biologique et informatique

      respm2gbi@univ-evry.fr

      Béndédicte STURBOIS: parcours Génomique végétale

    Départements
    UFR

      Scolarité

      Semestre 3

      Cette spécialité est composée de 2 parcours recherche : Génomique Végétale (GV) et Génomique Microbienne (GM) et d’un parcours professionnel : Génie Biologique et Informatique (GBI).  

      Parcours GM et GV

      CM : Cours Magistraux / TD : Travaux Dirigés / TP : Travaux Pratiques

      Unités d’enseignement

      Eléments constitutifs de l’unité d’enseignement

      Parcours GM

      Parcours GV

      Obligatoire

      Option

      CM

      TD

      TP / Projets tutorés

      UE 1 : Génomique

       

       

       

      X

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE1c1 : Génomique structurale et fonctionnelle appliquée

       

       

      X

       

      19

      16

      14

      UE 2 : Expression génique

      Les étudiants GM choisissent entre l’UE2 et l’UE3

       

       

      X

       

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE2c1 Régulation de l’expression génique Eucaryote

       

       

       

       

      X

       

      20

      22

      8

      UE 3 : Protéomique

       

      Les étudiants GM choisissent entre l’ UE2 et l’UE3

       

       

      X

       

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE3c1 : Protéomique des complexes

       

       

       

      X

       

      27

      24

       

      UE 4 : Les plantes et leurs gènes

       

      Les deux UE4c sont obligatoires

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE4c1 Génomique fonctionnelle appliquée aux plantes

       

       

       

      X

       

      9

      8

      8

       

      UE4c2 : Génétique végétale

       

       

      X

       

      13,5

      12

       

      UE  5 : La plante et son environnement

       

      Les étudiants devront choisir 2 UEc parmi les 3

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE5c1 : Interactions et symbiose chez les plantes

       

       

       

       

       

      X

      10,5

      10,5

      4

       

      UE5c2 : Stress abiotiques

       

       

       

       

      X

      13,5

      12

       

       

      UE5c3 : Bioproduction végétale

       

       

       

       

      X

      10

      16

       

      UE 6 : les génomes de microorganismes cultivables

       

      Les 2 UEs sont Obligatoires

      X

       

       

       

       

       

       

       

       

       

      UE6c1 : analyse comparée des génomes procaryotes

       

       

       

       

       

       

      X

       

      10

      16

       

       

      UE6c2 : analyse comparée des génomes Eucaryotes

       

       

       

       

      X

       

      15

      10

       

      UE 7 : Les écosystèmes microbiens complexes

       

       

       

       

      X

       

       

       

       

       

       

       

      UE7c1 : Interactions des microorganismes avec leur environnement

       

       

      X

       

      18

      8

      24

      UE8 : Métagénomique et métabolisme

       

      Les étudiants doivent suivre obligatoirement l’UE8c1 et faire un choix parmi les 2 UEc restantes

       

       

       

       

      X

       

       

       

       

       

       

       

      UE8c1 : Métagénomique de l’environnement

       

       

       

      X

       

      15

      10

       

       

      UE8c2 : Synthetic biology for biosynthetic chemistry

       

       

       

       

       

       

       

      X

      15

      10

       

       

      UE8c3 : Génomique métabolique

       

       

       

       

       

       

      X

      10,5

      10,5

      4

      UE12 : Langues vivantes

       

      Les 2 UEc sont obligatoires

       

      X

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE12c1. LV1

       

       

      X

       

       

      25

       

       

      UE12c1. LV2

       

       

      X

       

       

      25

       

      Parcours GBI

      Unités d’enseignement

      Eléments constitutifs de l’unité d’enseignement

      Obligatoire

      Option

      CM

       

       

       

      TD

      TP/Projets Tutorés

       

      UE 1 : Génomique

       

       

       

       

       

       

       

       

       

      UE1c1 : Génomique structurale et fonctionnelle appliquée

      X

       

      19

      16

       

      14

       

      UE 2 : Expression génique

       

      Les étudiants choisissent soit l’UE2 soit l’UE3

       

       

       

       

       

       

      UE2c1 : Régulation de l’expression génique eucaryote

       

      X

      20

      22

      8

      UE 3 : Protéomique

       

      Les étudiants choisissent soit l’UE2 soit l’UE3

       

       

       

       

       

       

      UE3c1 : Protéomique des complexes

       

      X

      27

      24

       

      UE9:Mathématique

       

      LES 2 UE9c sont obligatoires

       

       

       

       

       

       

      UE9c1 : Chaînes de Markov avancées

       

      X

       

       

       

       

       

      UE9c2 : Analyse des données 

      X

       

       

       

       

      UE  10 : Informatique

       

      LES 3 UE10c sont obligatoires

       

       

       

       

       

       

      UE10c1 : Modélisation et simulation avancée

       

       

      X

       

       

       

       

      UE10c2 : Fouille de données

       

       

      X

       

       

       

       

      UE10c3 : Systèmes d’intégration

       

      X

       

       

       

      UE 11 : Enseignements professionnalisants

       

       

       

       

       

       

       

      UE11c1 : Connaissances du monde professionnel

      X

       

       

       

       

       

      UE11c2 : projet informatique professionnel

       

       

       

       

       

      UE12 : Langues vivantes

       

      Les 2 UEc sont obligatoires

       

       

       

       

       

       

      UE12c1. LV1

      X

       

       

      50

       

       

      UE12c2. LV2

      X

       

       

      50

       

      Semestre 4

      Parcours GM et GV

      Unités d’enseignement

      Eléments constitutifs de l’unité d’enseignement

      Parcours GM

      Parcours GV

      Obligatoire

      Option

      CM

      TD

      TP / Projets tutorés

      UE13 : Langues vivantes

       

      Les 2UEc sont obligatoires

       

      X

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE13c2. LV2

       

       

      X

       

       

      25

       

       

      UE13c2. LV1

       

       

      X

       

       

      25

       

      UE14 : Stage

       

      Stage obligatoire

       

      X

       

      X

       

      X

       

       

       

       

       

      UE14c1 : Rapport écrit

       

       

      X

       

      NA

      NA

       

       

      UE14c2 : soutenance orale

       

       

      X

       

      NA

      NA

       

       

      UE14c3 : Appréciation du maître du stage

       

       

      X

       

      NA

      NA

       

      Parcours GBI

      Unités d’enseignement

      Eléments constitutifs de l’unité d’enseignement

      Obligatoire

      Option

      CM

      TD

      TP / Projets tutorés

      UE13 : Langues vivantes

       

      Les 2 UEc sont obligatoires

       

       

       

       

       

       

       

      UE13c2. LV2

      X

       

       

      50

       

       

       

      UE13c1. LV1

      X

       

       

      50

       

       

      UE14 : Stage 

       

       

       

      X

       

       

       

       

       

       

      UE14c1. Rapport écrit

       

      X

      NA

      NA

      NA

       

       

      UE14c2 soutenance orale

       

      X

      NA

      NA

      NA

       

       

      UE14c3. Appréciation du maitre du stage

       

      X

      NA

      NA

      NA

       

      Le Master est réparti sur deux années (M1 et M2) ou sur quatre semestres universitaires. Chaque année se décompose en deux semestres d’enseignement. Les cours, Travaux Dirigés (TD) et Travaux Pratiques (TP), sont organisés en Unités d’Enseignements (UE).

       Cette spécialité de master est composée de 3 parcours ; deux parcours à visée plutôt recherche, les parcours Génomique Microbienne (GM) et Génomique Végétale (GV) et un parcours à visée plutôt professionnelle, le parcours Génie Biologique et Informatique (GBI).

       Le semestre 1 est constitué essentiellement de Cours Magistraux (CM)/séminaires, TD et TP.

       Le semestre 2 est plutôt axé sur une immersion, d’une durée de 22 semaines, dans le milieu professionnel que ce soit un laboratoire de recherche ou une entreprise privée. Cette expérience sera finalisée sous la forme d’un mémoire et d’une soutenance orale.

      Université d'Evry-Val-d'Essonne Boulevard François Mitterrand 91025 Evry Cedex - Contacts - Plan du site | Informations légales | Communauté Universitaire (ENT)