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INSTITUT DE BIOLOGIE SYSTÉMIQUE ET SYNTHÉTIQUE (ISSB) - EA 4527 / FRE 3561

dernière mise à jour : 05/12/2013

L'Institut de Biologie Systémique et Synthétique (iSSB) est un laboratoire mixte universitaire créé en 2010 avec le soutien de Genopole et du CNRS. L'iSSB est structuré en cinq équipes de recherche. La biologie systémique intègre études expérimentales, théoriques et informatiques pour modéliser le fonctionnement de systèmes vivants (équipes MEGA et Metamorphosys). La biologie de synthèse utilise les modèles de biologie systémique pour concevoir, construire, et valider de nouveaux circuits biologiques insérés dans des microorganismes (équipes Xenome, Synth-Bio et Bio-RetroSynth). Le projet commun de l’iSSB vise à concevoir, construire et caractériser des circuits génétiques spacio-temporels sécurisés pour comprendre et contrôler l’expression génétique.  

Contact
Secrétariat

Genopole Campus 1, Bâtiment 6
5, rue Henri Desbruères
91030 EVRY cedex
Téléphone : +33 1 69 47 44 30
Fax : +33 1 69 47 44 37
Contact : sylvie.bobelet (at)
issb.genopole.fr

> plan d'accès

THÈMES ET ÉQUIPES

Thèmes :

 

 Equipe 1 Bio-RetroSynth

La thématique de l’équipe dirigée par Jean-Loup Faulon porte sur l’utilisation des méthodes de retrosynthèse pour concevoir et construire de nouveaux réseaux métaboliques. La rétrosynthèse consiste à déterminer un ensemble d’enzymes exogènes qui, une fois introduits dans un organisme hôte, produisent un composé cible. La méthode est appliquée à la production de produits thérapeutiques par des souches bactériennes.

Pour en savoir plus, consultez le site web de l'équipe Bio-RetroSynth : http://www.issb.genopole.fr/~faulon

 

Equipe 2 MEGA (Modelling and Engineering Genome Architecture)

L’équipe dirigée par François Képès analyse la topologie de réseaux transcriptionnels dans le temps (études dynamiques) et dans l'espace. Les travaux récents de l’équipe portent sur l'organisation fonctionnelle du noyau, ainsi que de l'évolution et de l'organisation des génomes. Ils suggèrent des expériences à la paillasse, visant à l'ingénierie régulatoire de la cellule à l'échelle génomique.

 

Equipe 3 Metamorphosys

L’équipe dirigée par Nicolas Pollet étudie le génome de l’amphibien anoure Xenopus tropicalis au travers de trois thématiques :

  • structure du génome, en caractérisant les différentes familles de transposons à ADN chez les xénopes et en les utilisant dans des expériences d’ingénierie du génome
  • expression du génome, en caractérisant les transcriptomes au cours de l’ontogenèse (développement précoce et métamorphose)
  • évolution des génomes, en analysant l’évolution des transposons et de gènes régulateurs de l’ontogenèse

Pour en savoir plus, consultez le site web de l'équipe Metamorphosys : http://indigene.epigenomique.genopole.fr/

Equipe 4  Synth-Bio

Les travaux du groupe dirigé par Alfonso Jaramillo se regroupent autour de plusieurs aspects du design de réseaux biologiques et de la biologie de synthèse, incluant le design de protéines et d'enzymes, mais aussi de l'ingénierie métabolique et la biologie systémique.  L’équipe met au point des méthodes computationnelles pour l'aide au design de circuits biologiques et métaboliques au sein de bactéries. Ces circuits biologiques, transcriptionnels ou d'ARNs, sont ensuite caractérisés in vivo. Les résultats expérimentaux nourrissent enfin les modèles établis et referment ainsi la boucle.

Equipe 5 Xenome

L’équipe Xenome développe des outils pour synthétiser et répliquer des acides nucléiques artificiels (XNA) qui n’interfèrent pas avec les systèmes naturels. L’objectif est de fabriquer des micro-organismes dont la génération in vivo et les fonctions pourront être strictement contrôlées, permettant ainsi le développement de nouvelles applications industrielles.

 

 

 

 

Membres :

 

 

MEMBRES

Membres :

 

Pour nous joindre par e-mail : prénom.nom (at) issb.genopole.fr

  • Saman Abdulla - Doctorant (équipe MEGA)
  • Sylvie Bobelet – Secrétariat, CNRS
  • Costas Bouyioukos - Chercheur CDD (équipe MEGA)
  • Darren Braddick - Post-doc (équipe Xenome)
  • Noémie Brisemeur - Assistante ingénieur CDD (équipe MEGA)
  • Pablo Carbonell - Chercheur CDD (équipe Bio-RetroSynth)  -  
Web : http://www.issb.genopole.fr/~carbonell
  • Bruno Colombo - Professeur Université d'Évry Val-d'Essonne (équipe Metamorphosys)
  • Mohamed Elati - Maître de Conférence, Université d'Évry Val-d'Essonne (équipe MEGA)  -  Web : http://www.issb.genopole.fr/~elati
  • Marina Elez - Maître de Conférence, Université d'Évry Val-d'Essonne (équipe Synth-Bio)
  • Jean-Loup Faulon - Professeur, Université d'Évry Val-d'Essonne, directeur de l'iSSB
 (Directeur de l'équipe Bio-RetroSynth)
  -  Web : http://jfaulon.wikispaces.com
  • Tamas Feher - Post-doc (équipe Bio-RetroSynth)
  • Alfred Fernandez-Castane - Post-doc (équipe Bio-RetroSynth)
  • Cécile Gasse - Maître de Conférence, Université d'Évry Val-d'Essonne (équipe Xenome)
  • Anne Giraut - Post-doc (équipe Xenome)
  • Camille Hassan - Assistante Ingénieur CDD (équipe Xenome)
  • Piet Herdewijn - Professeur, Université d'Évry Val-d'Essonne (Directeur de l'équipe Xenome)
  • Joan Hérisson - Ingénieur de recherche, Université d'Évry Val-d'Essonne (Plateforme de Biologie de Synthèse)
  • Laurent Jannière - CR1 CNRS (équipe MEGA)
  • Alfonso Jaramillo - CR1 CNRS (Directeur de l'équipe Synth-Bio)
  • Brian Jester - Chercheur CDD (équipe MEGA)
  • François Képès - DR2 CNRS (Directeur de l'équipe MEGA)  -  Web : http://www.issb.genopole.fr/~kepes
  • Boris Kirov - Doctorant (équipe Synth-Bio)
  • Konstantin Koutroumpas - Post-doc (équipe MEGA)
  • Thomas Landrain - Doctorant (équipe Synth-Bio)
  • Bernadette Lauret - Gestionnaire CNRS
  • Thibaut Lepage - Doctorant (équipe MEGA)
  • Guillaume Le Treut - Doctorant (équipe MEGA)
  • Vincent Libis - Doctorant (équipe Bio-retroSynth)
  • Philippe Marlière - Directeur de Recherche (équipe Xenome)
  • Mariel Montesinos - administration (équipe Synth-Bio)
  • Remy Nicolle - Doctorant (équipe Bio-RetroSynth)
  • Cyrille Pauthenier - Doctorant (équipe Bio-RetroSynth)
  • Julio Peironcely - Doctorant (équipe Bio-RetroSynth)
  • Valérie Pezo - CR CEA (équipe Xenome)
  • Nicolas Pollet - CR1 CNRS (Directeur de l'équipe Metamorphosys)
  • Ioana Popescu (Grigoras) - Maître de Conférence, Université d'Évry Val-d'Essonne (équipe Bio-RetroSynth)
  • Satya Prakash Rajput - Doctorant (équipe Synth-Bio)
  • William Rostain - Doctorant (équipe Synth-Bio)
  • Thibault Scalvenzi - Doctorant (équipe Metamorphosys)
  • Shensi Shen - Post-doc (équipe Synth-Bio)
  • Aurore Thélie - Post-doc (équipe Metamorphosys)
  • Lena Vouillot - Doctorante (équipe Metamorphosys)
  • Dominique Zeliszewski - CR1 CNRS, communication scientifique

 

 

PUBLICATIONS

Autres publications


Vous pouvez consulter la liste de nos publications en suivant ce lien : publications iSSB

 

MANIFESTATIONS

Autres manifestations

 Ecole Thématique CNRS "Avancées en Biologie des Systèmes et de Synthèse - Modélisation de systèmes Biologiques complexes dans le contexte de la génomique"

DU 24 au 28 mars 2014 à Evry (hôtel Ibis Style)

Pour plus d'informations :http://epigenomique.free.fr/fr/index.php

 

COLLABORATIONS

Réseau de recherche

- Era-Sys Bio

- Era-Syn Bio

- Consortium BioIntelligence

- GDRE 513 CNRS

-

 

Collaborations internationales

 Nombreuses collaborations aux USA, en Espagne, Belgique, Pologne, Angleterre, etc

 

Plateforme scientifique

 Plate-forme de Biologie Synthétique : http://www.issb.genopole.fr/Technology

FORMATIONS

Formations attachées

Ecole doctorale

  •  Ecole doctorale GAO

Masters attachés

Thèses en cours

Boris Kirov (équipe Synth-Bio)

Thomas Landrain (équipe Synth-Bio)

Thibaut Lepage (équipe MEGA)

Guillaume Le Treut (équipe MEGA)

Vincent Libis (équipe Bio-RetroSynth)

Remy Nicolle (équipe Bio-RetroSynth)

Cyrille Pauthenier (équipe Bio-retroSynth)

Julio Peironcely (équipe Bio-RetroSynth)

Satya Prakash Rajput (équipe Synth-Bio)

Thibault Scalvenzi (équipe Metamorphosys)

Lena Vouillot (équipe Metamorphosys)

 

Supports et matériels pédagogiques

 

 

INFORMATIONS PRATIQUES

Responsable du laboratoire : Pr. Jean-Loup FAULON

Fax : +33 1 69 47 44 37

 

 

 

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