Découvrez notre formation courte en bio-informatique

L’Université d’Evry, en partenariat avec l'équipe LABGeM du Genoscope, organise depuis 2013 à raison de 2 sessions par an des formations dédiées à l'analyse de génomes bactériens via l'utilisation de la plate-forme MicroScope.

Les prochaines formations «Annotation and analysis of prokaryotic genomes using the MicroScope platform» auront lieu à Evry, du 16 au 20 Mars 2020 et du 23 au 27 Novembre 2020

 

 

Annotation et Analyse de Génomes Procaryotes - Mise en oeuvre de la plateforme MicroScope

Public

Cette formation s'adresse:

  • aux personnes ayant déjà un projet d'annotation sur cette plate-forme et souhaitant approfondir son utilisation
  • aux personnes souhaitant s'initier à la génomique microbienne

Objectifs

  • acquérir les connaissances théoriques et pratiques des outils d’annotation de génomes (annotation structurale et fonctionnelle, annotation de réseaux métaboliques)
  • interpréter les résultats des outils d’annotation fonctionnelle
  • faire des analyses comparatives variées : analyses de synténies conservées, pan-génomes, profils phylogénétiques et métaboliques
  • interpréter les résultats des outils de prédiction de réseaux métaboliques et à rechercher des gènes candidats pour des activités enzymatiques
  • appliquer les outils enseignés à l’analyse de génomes d’intérêt pour les participants

Modalités pédagogiques

  • Apports théoriques et méthodologiques (50%)
  • Mise en pratique (50%)

NB: les participants ont la possibilité de travailler sur leurs propres données pendant les travaux pratiques.

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